В 1989 году окончил лечебный факультет второго МОЛГМИ им. Н.И. Пирогова и в том же году начал работу в качестве врача-хирурга в Российском Научном центре хирургии им. академика Б.В. Петровского. В 1997году защитил кандидатскую диссертацию. С 2006 г. по 2018 год работал в должности доцента на кафедре госпитальной хирургии №2 лечебного факультета Первого МГМУ им. И.М. Сеченова.
Вахратьян П.Е. владеет всеми видами сосудистых операций на различных сосудистых бассейнах. Занимается хирургическим лечением пациентов с артериальной и венозной патологией, хронической венозной недостаточностью и варикозной болезнью нижних конечностей, применяя как классические, так и современные передовые эндовазальные методы лечения, в том числе лазерные технологии.
Вахратьян П.Е. имеет действующие сертификаты по специальностям хирургия и сердечно-сосудистая хирургия, является действительным членом Российского общества хирургов (РОХ), Российского общества ангиологов и сосудистых хирургов (РОАиСХ), членом Ассоциации флебологов России (АФР), имеет более 96 печатных работ, соавтор двух учебных пособий, соавтор 1-го патента на изобретение. Активно занимается научно-исследовательской работой, участвует в конференциях и других научных форумах в России и за рубежом.
Вахратьян П.Е. отмечен наградами министерства здравоохранения, награжден почетным знаком «Отличник здравоохранения» в 2014г и отмечен в книге «Лучшие врачи Москвы» за 2009 и 2012 годы.
